En 1929, un premier groupe de Frères de la Charité des Pays-Bas est parti s’installer en Indonésie afin d’y ouvrir une école. La première fondation a été à Purworejo. Les années de guerre étaient très pénibles. La plupart des missionnaires sont rentrés aux Pays-Bas, d’autres ont été emprisonnés dans les camps.
Grâce à la présence des « Frères de l’Amour Divin » – fondation initiale par les Frères de la Charité qui a été intégrée plus tard dans la Congrégation – ils ont pu revenir en Indonésie après la guerre. Ils ont repris en charge l’enseignement, avec des fondations à Purworejo, Purwokerto et Yogyakarta, et un institut nouveau pour l’éducation des enfants avec un handicap auditif à Wonosobo.
Depuis les années ’90, des initiatives nouvelles ont vu le jour : les soins aux enfants et jeunes avec un handicap mental (Boro), l’assistance des personnes souffrant de toxicomanie (Yogyakarta), et les soins aux patients psychiatriques à Purworejo et Ruteng (Flores).
Avec la fondation en Indonésie, les Frères de la Charité sont parvenus en Asie. Plusieurs frères originaires de l’Indonésie aident actuellement à étendre la Congrégation dans plusieurs autres pays.